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　　本区地处蒙古高原东南边缘，浑善达克沙地东北部的草原上，位于我国东北，华北和大兴安岭植物分布交错地带，区内地貌类型主要为沙地、低山丘陵和河谷等，海拔高度在1300—1500米，植物以蒙古系为主，据不完全统计共有高等植物68科239属460种。区内分布有大面积的天然沙地云杉林，被学术界称为“在内蒙古高原草原区残存的唯一的一个暗针叶林天然生物基因库。”保护区独特的地理位置还为野生动物提供了较为理想的栖息繁衍和停歇场所，形成了较为复杂的野生动物种群，境内分布的国家重点保护野生动物有大鸨、灰鹤、天鹅、蓑羽鹤、马鹿、猞猁等。白音敖包保护区的建立，对于保护“三北”防保护林体系东部地区天然森林植被，保护当地的生态环境和草原畜牧业，研究沙地云杉的起源和分化均有着非常重要的意义。